Значение метагеномного секвенирования и выбора пробиотической терапии у пациента с длительной диареей

Резюме
Введение. Далеко не у всех пациентов с диареей удается в короткий срок выявить патологическую флору, установить диагноз и назначить эффективное лечение. По данным Роспотребнадзора, в Российской Федерации в этиологической структуре в течение многих лет традиционно преобладают случаи острых кишечных инфекций неустановленной этиологии, доля которых в 2024 году составила 62,4% при среднемноголетнем показателе 64,1%. Причины отрицательных результатов лабораторной диагностики могут быть разные: потеря жизнеспособности возбудителя при хранении биоматериала или при транспортировке, отсутствие лабораторных условий для роста микроорганизмов (например, бескислородной среды для анаэробных бактерий), несоответствие последовательностей нуклеиновых кислот вследствие мутаций при детекции методом полимеразной цепной реакции и другие.
Результаты. Представлен клинический пример, демонстрирующий роль метагеномного секвенирования для последующего выбора оптимальной схемы лечения у пациента с длительной диареей, сопровождающейся метеоризмом и эпизодами дискомфорта или болей в в животе, с отсутствием положительного результата от проводимой ранее терапии. Метагеномное секвенирование позволило получить полную картину состава микробиома, что дало возможность установить взаимосвязи между жалобами, подтвержденными в ходе предыдущих обследований диагнозами и отсутствием результатов предшествующей терапии, а также назначить оптимальное лечение. По результатам обследования установлена связь между особенностями состава микробиома с повышенным провоспалительным и патогенным потенциалами за счет соответствующих микроорганизмов, клинико-лабораторными признаками энтероколита и морфологически подтвержденным аутоиммунным атрофическим гастритом. В соответствии с полученными данными назначено лечение бактериофагом и препаратом, содержащим комбинацию пробиотических штаммов Lactobacillus rhamnosus LGG® и Bifidobacterium BB-12® в составе биологически активной добавки к пище (Адиарин® Пробио). Выбор данных штаммов обусловлен их доказанным антагонистическим действием против патогенных (включая основные бактериальные возбудители острых диарей – Salmonella и Shigella) и условно-патогенных (в том числе против Candida и Clostridium difficile) бактерий, наличием противовоспалительной и иммуномодулирующей активности. В ходе исследований была доказана способность взаимно усиливать адгезивные и антидиарейные свойства при совместном применении этих штаммов. Лактобактерии LGG®, входящие в назначенную комбинацию, обладают высоким уровнем адгезии к эпителию слизистой оболочки кишечника, что позволяет этим бактериям оставаться в организме человека и проявлять свое действие в течение продолжительного времени поддерживая муциновый слой и предотвращая гибель клеток внутренней стенки кишки. При пероральном применении оба штамма LGG® и ВВ-12® сохраняют жизнеспособность при прохождении через среды желудка и двенадцатиперстной кишки. На фоне лечения достигнуто значительное улучшение самочувствия пациента и результатов дополнительных обследований.
Конфликт интересов. Авторы статьи подтвердили отсутствие конфликта интересов, о котором необходимо сообщить.

Диарея относится к симптомам, которые существенно ухудшают качество жизни пациента. Во многих случаях она сопровождается рядом других жалоб, по анализу которых можно предположить тот или иной диагноз и назначить правильную терапию. Дифференциальную диагностику для определения тактики лечения проводят между бактериальными и вирусными острыми кишечными инфекциями, возбудителями протозойной этиологии, гельминтной инвазией, антибиотикоассоциированной диареей. Сходная симптоматика может отмечаться при неспецифическом язвенном колите, болезни Крона, онкологической патологии, язвенной болезни желудка и двенадцатиперстной кишки, ишемическом колите [1]. Отсутствие своевременной правильной терапии, которая невозможна без правильного диагноза, может привести к различным осложнениям, в том числе тяжелым, и даже к летальным исходам вследствие нарастания обезвоживания, дисэлектролитных нарушений, интоксикации и продолжающегося действия этиологического фактора [2, 3].

Однако далеко не у всех пациентов удается в короткий срок выявить патологическую флору, установить диагноз и назначить эффективное лечение. По данным Роспотребнадзора, в Российской Федерации в этиологической структуре в течение многих лет традиционно преобладают случаи острых кишечных инфекций неустановленной этиологии, доля которых в 2024 году составила 62,4% при среднемноголетнем показателе 64,1% [4]. Причины отрицательных результатов лабораторной диагностики могут быть разные: потеря жизнеспособности возбудителя при хранении биоматериала или при транспортировке, отсутствие лабораторных условий для роста микроорганизмов (например, бескислородной среды для анаэробных бактерий), несоответствие последовательностей нуклеиновых кислот вследствие мутаций при детекции методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) и другие [5-7].

Необходимость выявления этиологического фактора для определения тактики лечения и ответственного выбора оптимальной схемы терапии показывает следующий клинический случай.

Мужчина С., 49 лет, обратился с жалобами на эпизоды неоформленного или водянистого стула без примесей от 2 до 7 раз в сутки, чаще в утренние часы после пробуждения, метеоризм, иногда – дискомфорт или боли в животе, преимущественно вокруг пупка и в нижней части.

Из анамнеза: нарушения стула со склонностью к диарее, эпизоды вздутия живота с периодами болей в животе беспокоят в течение примерно 30 лет. Многократно обследован, консультирован терапевтами и гастроэнтерологами, проведены повторные курсы антибактериальной терапии. Получал курсами ингибиторы протонной помпы, антацидные и пробиотические препараты, энтеросорбенты, гастропротекторы, спазмолитики, ветрогонные, в основном с положительным, но не устойчивым результатом, возобновлением симптоматики после отмены терапии. Около 1,5 лет назад отмечал эпизод сильных болей в животе, после чего в течение нескольких месяцев беспокоили изжога и дискомфорт после еды.

Употребляет преимущественно продукты животного происхождения (говядину, птицу, яйца), поскольку растительная пища вызывает более выраженные позывы к дефекации.

Аллергические реакции не подтверждены (отмечает эпизоды появления пятнисто-папулезных высыпаний, в основном на туловище, однако по результату анализа крови на широкий спектр аллергенов по специфическим антителам IgE значимых превышений референсных значений выявлено не было).

По результатам анализа крови: антитела к париетальным клеткам желудка 5120 Ед/мл (референсные значения 0-10,0 Ед/мл), антитела к внутреннему фактору Касла – 0,4 Ед/мл (референсные значения 0-6,0 Ед/мл), гастрин-17 базовый – > 28,5 пмоль/л (референсные значения 1,0-7,0 пмоль/л), пепсиноген I – 17,6 мкг/л (референсные значения 30,0-160,0 мкг/л), С-реактивный белок – 12,4 мг/л (референсные значения 0,0-5,0 мг/л), IgE – 141 МЕ/мл (референсные значения 0,0-100,0 МЕ/мл), альбумин – 67,36% (референсные значения 55,0-67,0%); трансаминазы, креатинин, мочевина, мочевая кислота, панкреатическая амилаза, общий белок, холестерин, липидный профиль, калий, кальций, магний, натрий, хлор, коагулограмма – в пределах референсных значений. По результатам анализа кала: кальпротектин – 262 мкг/г (референсные значения 0,0-80,0 мкг/г), большое количество непереваренных мышечных волокон, остальные показатели в пределах референсных значений. Тест на токсины клостридий А и В – отрицательный. Водородный дыхательный тест положительный. При генетическом обследовании на наличие полиморфизма гена лактазной недостаточности выявлен тип С/Т (низкая активность лактазы, на основании чего рекомендована диета с низким содержанием молочных продуктов).

По эзофагогастродуоденоскопии – атрофия тела желудка 3-й степени, Helicobacter pylori не обнаружен. При колоноскопии удалена тубулярная аденома толстой кишки, при повторном осмотре через полгода данных за патологию не выявлено, по данным биопсии целиакия исключена, микроскопический колит исключен. По результатам ультразвукового исследования органов брюшной полости отмечаются взвесь в желчном пузыре, неравномерное повышение эхогенности поджелудочной железы.

Результаты исследования кала на дисбиоз микробиологическим методом представлены в табл. 1.

По результатам обследования выявлен дефицит лактобактерий.

На основании результатов обследования поставлен диагноз: «Дисбиоз кишечника II степени, синдром избыточного бактериального роста, аутоиммунный атрофический гастрит, синдром раздраженного кишечника». Назначен пробиотик, содержащий лактобактерии, на 2 недели, диета – стол № 2 по Певзнеру.

При консультации через 1 месяц не отмечено положительной динамики, при лабораторном обследовании выявлены более выраженные дисбиотические изменения (табл. 2).

Таким образом, методом ПЦР в реальном времени (ПЦР-РВ) выявлено снижение общего количества бактерий в кале, существенно снижено количество Lactobacillus spp. и Bifidobacterium spp.; повышено количество Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Enterobacter spp.; обнаружен анаэробный дисбаланс (количество бактероидов значительно превышает количество Faecalibacterium prauznitzii). По этим результатам, учитывая сохраняющиеся жалобы на диарею с эпизодами дискомфорта и болей в животе, были назначены рифаксимин на 7 дней, затем препарат, содержащий Sacharomyces boulardii на 3 недели, затем пробиотический состав, содержащий лакто- и бифидобактерии на 4 недели в сочетании со спазмолитиками, ветрогонными и энтеросорбентами. Существенного улучшения пациент не отметил, в связи с чем для исключения наличия патогенов, не выявляющихся микробиологически и методом ПЦР-РВ, а также для уточнения состава условно-патогенной флоры было проведено метагеномное секвенирование пробы фекалий.

На рис. 1 представлены основные роды и виды бактерий, которые были выявлены.

Как видно по рис. 1, среди родов и видов преобладает Klebsiella pneumoniae, которая известна преимущественно как этиологический фактор внутрибольничных пневмоний, регистрируется при остеомиелитах, а в последнее время рассматривается и как одна из причин формирования и прогрессирования воспалительных заболеваний кишечника [8]. Эта бактерия отличается множественной резистентностью к антибактериальным препаратам, быстрым увеличением количества при благоприятных условиях. В результате мутаций некоторые штаммы могут не выявляться при микробиологическом или ПЦР-исследованиях, что, по-видимому, и наблюдалось у данного пациента. Такой вывод можно сделать при учете отсутствия динамики жалоб с момента проведения первого исследования в апреле 2025 года.

На рис. 2 показано соотношение долей бактерий, обладающих патогенным, противовоспалительным и провоспалительным потенциалами.

Как видно из диаграммы на рис. 2, отмечается преоладание бактерий с провоспалительным и патогенным потенциалами, что объясняет увеличение значения кальпротектина в кале и болевой синдром.

В табл. 3 представлены процентные соотношения основных 100 выявленных родов бактерий. По нему видно, что количество лакто- и бифидобактерий (по 0,02%) крайне мало по сравнению с числом клебсиелл, гемофильной палочки и других. Отсутствие результата лечения пробиотическими препаратами может быть объяснено низкой функциональной активностью рекомендованных штаммов, быстрой их элиминацией из кишечника в условиях преобладания условно-патогенных бактерий и отсутствием субстрата для размножения благоприятной флоры (употребление пациентом малого количества растительной пищи). Полученные значения представителей микробиома объясняют и формирование неустойчивых кожных реакций в виде пятнисто-папулезных высыпаний с небольшим повышением IgE, аутоиммунного атрофического гастрита. Низкие количества лактобактерий, а также микроорганизмов, имеющих противовоспалительный потенциал (в основном Akkermansia muciniphilia и Faecalibacterium prausnitzii), ассоциированы с воспалительными проявлениями в желудочно-кишечном тракте, с недостатком экспрессии белков плотных контактов и, в результате, с утечкой крупных молекул, в том числе липополисахаридов бактериальных оболочек, через стенку кишечника [8]. Такая ситуация вызывает или усугубляет системное воспаление, которое подтверждено у нашего пациента по повышению уровня С-реактивного белка.

Обращают на себя внимание показатели по доли шигелл, сальмонелл и иерсиний, превышающие показатели лакто- и бифидобактерий. При дисбиозе, особенно в сочетании с атрофией слизистой оболочки желудка, ожидаемо снижение резистентности желудочно-кишечного тракта к патогенам. Наиболее вероятно, что у пациента эпизоды усугубления жалоб были связаны с этими возбудителями. Назначенное ранее лечение должно было действовать против этих патогенов, но не достигало стойкой ремиссии.

По результатам анализа вклада представителей грибов и вирусов не выявлено клинически значимых показателей.

С учетом полученных данных установлен диагноз: «Дисбиоз III степени. Синдром избыточного бактериального роста. Атрофический аутоиммунный гастрит. Хронический энтероколит. Хронический панкреатит вне обострения».

Длительное сохранение диареи и сопутствующих жалоб, вероятно, было связано с последовательным изменением ведущей причины (количества и соотношения различных патогенов – возбудителей острых кишечных инфекций, дисбиоза, панкреатита, атрофического гастрита).

Рекомендовано:

1. Клебсиеллезный бактериофаг 20 мл 3 раза в день внутрь за 1 час до еды в течение 7 дней.
2. С целью обеспечения условий для роста представителей микробиома, обладающих противовоспалительным потенциалом:
   • диета с увеличением содержания клетчатки (овощей и фруктов около 60% от всего рациона, с учетом переносимости, термически и/или механически обработанных, зелень и неострые приправы натурального происхождения), с уменьшением доли мясо-молочных продуктов и птицы (до 25%, с обязательным употреблением натуральных нежирных кисломолочных продуктов), с исключением продуктов, содержащих консерванты;
   • пробиотик с содержанием лакто- и бифидобактерий (биологически активная добавка к пище (БАД) Адиарин® Пробио, капли для приема внутрь масляные по 12 капель в сутки) на 2 месяца с последующей коррекцией схемы лечения по результатам повторного обследования на дисбиоз методом NGS (Next-Generation Sequencing, или секвенирование нового поколения).
3. С целью компенсации секреторной недостаточности: препараты на основе ферментов 1-3 раза в день с едой.
4. При болях/спазмах в животе: спазмолитики.

На фоне лечения отмечены улучшение самочувствия, снижение частоты стула, купирование болей в животе, уменьшение уровня кальпротектина в кале и С-реактивного белка в крови.

Хороший результат лечения связан, очевидно, с подавлением активности клебсиеллы бактериофагом и последующим применением препарата, содержащего штаммы лактобактерий Lactobacillus rhamnosus LGG® и бифидобактерий Bifidobacterium BB-12®, входящих в БАД Адиарин® Пробио с подтвержденной антагонистической эффективностью против патогенных и условно-патогенных бактерий. Действие штамма лактобактерий LGG® оценено более чем в 300 клинических исследованиях, в том числе 12 – российских. По их результатам и доклинической оценке опубликовано более 1100 работ. Подтверждена их высокая степень адгезии к эпителию слизистой оболочки кишечника за счет особых жгутикоподобных волосков, находящихся на поверхности, – так называемых пилей, что позволяет этим штаммам оставаться в организме человека и проявлять свое действие в течение продолжительного времени [9]. В условиях эксперимента на лабораторных моделях животных была доказана способность штамма лактобактерий LGG® подавлять активность шигелл, сальмонелл и ряда других нежелательных для желудочно-кишечного тракта человека микроорганизмов [10, 11]. Так, Y. Чжан и соавторы [10] сообщали, что L. rhamnosus способны ингибировать Shigellasonnei в условиях in vitro, а C. Marianelli и соавторы показали их свойство ингибировать Salmonellaenterica subsp. серовар enterica Typhimurium 1344 in vitro [11]. Другие исследователи обратили внимание на то, что L. rhamnosus (LGG®) предотвращают колонизацию кишечника различными видами Candida [12, 13], а также купируют проявления колита, вызванного Clostridium difficile, у детей [14]. Антагонистическое действие против основных возбудителей, обусловливающих диарею, обеспечивает надежное антидиарейное действие штамма LGG®, входящего в состав Адиарин® Пробио [15].

Также было показано их противовоспалительное действие: LGG® в условиях эксперимента in vitro снижали продукцию провоспалительных цитокинов [16]. Также доказана способность штамма лактобактерий LGG® поддерживать муциновый слой и предотвращать гибель клеток эпителия кишечника, препятствовать повторным эпизодам кишечных инфекций и подавлять активность условно-патогенной флоры, что играет значительную роль в лечении воспалительных процессов желудочно-кишечного тракта [17]. Однако благоприятные свойства при приеме внутрь могут проявиться только при сохранении жизнеспособности применяемых бактерий. Проведенное экспериментальное исследование показало, что именно коммерческий штамм лактобактерий LGG® обладает наилучшей выживаемостью при помещении на 90 минут в условия моделированной кислой среды желудка (рН 2,0) по сравнению с другими бактериями [18]. Все эти особенности обусловили выбор врачом лактобактерий LGG® для пациента С., рассмотренного в клиническом примере.

В свою очередь штамм ВВ-12®, которые также входят в состав назначенного пациенту Адиарин® Пробио, остается самым изученным среди бифидобактерий. Подтверждению эффективности и безопасности ВВ-12® при применении у детей и у взрослых посвящено более 130 клинических исследований, из которых лишь 12 проведено в России. По их результатам опубликовано более 300 статей. ВВ-12® также, как и LGG®, имеют антагонистическую активность против патогенных и условно-патогенных микроорганизмов. Штамм ВВ-12® продуцирует молочную (лактат) и уксусную (ацетат) кислоты, перекись водорода и бактериоцины, которые обеспечивают неблагоприятные условия для большого ряда патогенов [19, 20]. Для этих бифидобактерий доказан иммуномодулирующий и противовоспалительный эффекты [21].

В исследованиях было доказано, что комбинация LGG® и BB-12® способствует более выраженному проявлению действий обоих штаммов. Сочетание усиливает их адгезию к клеткам эпителия кишечника до 39-44% [22, 23], увеличивая антидиарейный эффект. Оба штамма устойчивы к действию агрессивной среды желудка и двенадцатиперстной кишки.

Одна доза (6 капель) Адиарин® Пробио содержит пробиотические штаммы LGG® и BB-12® в количестве не менее 109 КОЕ бактерий, вспомогательными веществами являются масло подсолнечника и α-токоферол, что позволило обеспечить нужный результат лечения и хорошую переносимость у нашего пациента при приеме по 2 дозы в сутки в течение 2 месяцев.

Таким образом, метагеномное секвенирование позволило получить полную картину состава микробиома, что дало возможность установить взаимосвязи между жалобами, подтвержденными в ходе предыдущих обследований диагно-зами и отсутствием результатов предшествующей терапии, а также назначить оптимальное лечение. Выбор БАД Адиарин® Пробио позволил достичь устойчивого улучшения самочувствия пациента и значительной положительной динамики лабораторных показателей длительно текущего воспалительного процесса желудочно-кишечного тракта.

Вклад авторов:
Концепция статьи — Руженцова Т. А.
Концепция и дизайн исследования — Руженцова Т. А.
Написание текста — Дудурич В. В.
Сбор и обработка материала — Руженцова Т. А.
Анализ материала — Руженцова Т. А.
Редактирование — Руженцова Т. А.
Утверждение окончательного варианта статьи — Руженцова Т. А.

Contribution of authors:
Concept of the article — Ruzhentsova T. A.
Study concept and design — Ruzhentsova T. A.
Text development — Dudurich V. V.
Collection and processing of material — Ruzhentsova T. A.
Material analysis — Ruzhentsova T. A.
Editing — Ruzhentsova T. A.
Approval of the final version of the article — Ruzhentsova T. A.

Литература/References

1. Руженцова Т. А., Плоскирева А. А., Горелов А. В. Острая диарея бактериальной этиологии: дифференциальная диагностика и лечение. Медицинский совет. 2016; 7: 78-81. DOI: 10.21518/2079-701X-2016-07-78-81. / Ruzhentsova T. A., Ploskireva A. A., Gorelov A. V. Acute diarrhea of bacterial etiology: Differential diagnosis and treatment. Meditsinskii sovet. 2016; 7: 78-81. DOI: 10.21518/2079-701X-2016-07-78-81. (In Russ.)
2. Руженцова Т. А., Плоскирева А. А., Горелов А. В. Осложнения ротавирусной инфекции у детей. Педиатрия. Журнал им. Г. Н. Сперанского. 2016; 95 (2): 38-43. / Ruzhentsova T. A., Ploskireva A. A., Gorelov A. V. Complications of rotavirus infection in children. Pediatriya. Zhurnal im. G. N. Speranskogo. 2016; 2 (95): 38-43. (In Russ.)
3. Горелов А. В., Николаева С. В., Усенко Д. В. и др. Эффективность применения нифуроксазида при острых кишечных инфекциях бактериальной этиологии у детей. Инфекционные болезни. 2018; 16 (2): 18-26. DOI: 10.20953/1729-9225-2018-2-18-26. / Gorelov A. V., Nikolaeva S. V., Usenko D. V., et al. The effectiveness of using nifuroxazide in acute intestinal infections of bacterial etiology in children. Infekc. bolezni. 2018; 16 (2): 18-26. DOI: 10.20953/1729-9225-2018-2-18-26. (In Russ.)
4. О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2024 году: Государственный доклад. М.: Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, 2025. 424 с. / On the state of sanitary and epidemiological welfare of the population in the Russian Federation in 2024: State Report. Moscow: Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Well-being. 2025. 424 с. (In Russ.)
5. Лямин А. В., Жестков А. В., Никитина Т. Р. и др. Общая характеристика и клиническое значение представителей родов Nocardia и Gordonia. Инфекция и иммунитет. 2019; 9 (3-4): 429-436. DOI: 10.15789/2220-7619-2019-3-4-429-436. / Lyamin A. V., Zhestkov А. V., Nikitina Т. R., et al. General characteristics and clinical significance of Nocardia и Gordonia genera. Infektsiya i immunitet. 2019; 9 (3-4): 429-436. DOI: 10.15789/2220-7619-2019-3-4-429-436. (In Russ.)
6. Vetor R., Murray C. K., Mende K., et al. The use of PCR/Electrospray Ionization Time of Flight Mass Spectrometry (PCR/ESITOF-MS) to detect bacterial and fungal colonization in healthy military service members. BMC Infectious Diseases. 2016; 16: 338. DOI: 10.1186/s12879-016-1651-7.
7. Осипов Г. А., Родионов Г. Г. Микроэкология человека в норме и патологии по данным масс-спектрометрии микробных маркеров. Медико-биологические и социально-психологические проблемы безопасности в чрезвычайных ситуациях. 2013; 2: 43-53. / Osipov G. A., Rodionov G. G. Human Microecology in Norm and Pathology According to Mass Spectrometry of Microbial Markers. Mediko-biologicheskie i socialno-psikhologicheskie problemy bezopasnosti v chrezvychainykh situatsiyakh. 2013; 2: 43-53. (In Russ.)
8. Kaur C. P., Vadivelu J., Chandramathi S. Impact of Klebsiella pneumoniae in lower gastrointestinal tract diseases. J Dig Dis. 2018; 19 (5): 262-271. DOI: 10.1111/1751-2980.12595.
9. Грибакин С. Г., Тимофеева А. Г., Боковская О. А. Пробиотик Lactobacillus rhamnosus GG (LGG®): что мы знаем об эффективности и безопасности? Лечащий Врач. 2019; 4: 92-95. / Gribakin S. G., Timofeeva A. G., Bokovskaya O. A. Probiotic Lactobacillus rhamnosus GG (LGG®): What do we know about effectiveness and safety? Lechaschi Vrach. 2019; 4: 92-95. (In Russ.)
10. Zhang Y., Zhang L., Du M., et al. Antimicrobial activity against Shigella sonnei and probiotic properties of wild lactobacilli from fermented food. Microbiol Res. 2011; 167 (1): 27-31. DOI: 10.1016/j.micres.2011.02.006.
11. Marianelli C., Cifani N., Pasquali P. Evaluation of antimicrobial activity of probiotic bacteria against Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium 1344 in a common medium under different environmental conditions. Res Microbiol. 2010; 161 (8): 673-680. DOI: 10.1016/j.resmic.2010.06.007.
12. Manzoni P., Mostert M., Leonessa M. L., et al. Oral supplementation with Lactobacillus casei subspecies rhamnosus prevents enteric colonization by Candida species in preterm neonates: A randomized study. Clin. Infect. Dis. 2006; 42: 1735-1742. DOI: 10.1086/504324.
13. Allonsius C. N., van den Broek M. F. L., De Boeck I., et al. Interplay between Lactobacillus rhamnosus GG and Candida and the involvement of exopolysaccharides. Microb. Biotechnol. 2017; 10: 1753-1763. DOI:10.1111/1751-7915.12799.
14. Boonma P., Spinler J. K., Venable S. F., et al. Lactobacillus rhamnosus l34 and Lactobacillus casei l39 suppress Clostridium difficile-induced il-8 production by colonic epithelial cells. BMC Microbiol. 2014; 14: 177. DOI: 10.1186/1471-2180-14-177.
15. Mathipa-Mdakane M. G., Thantsha, M. S. Lacticaseibacillusrhamnosus: A Suitable Candidate for the Construction of Novel Bioengineered Probiotic Strains for Targeted Pathogen Control. Foods. 2022; 11: 785. DOI:10.3390/foods11060785.
16. Donkor O. N., Ravikumar M., Proudfoot O., et al. Cytokine profile and induction of T helper type 17 and regulatory T cells by human peripheral mononuclear cells after microbial exposure. Clin Exp Immunol. 2012; 167 (2): 282-295. DOI: 10.1111/j.1365-2249.2011.04496.x.
17. Gaudier E., Michel C., Segain J. P., et al. The VSL# 3 probiotic mixture modifies microflora but does not heal chronic dextran-sodium sulfate-induced colitis or reinforce the mucus barrier in mice. J Nutr. 2005; 135 (12): 2753-2761. DOI: 10.1097/01.mco.0000247477.02650.51.
18. Corcoran B. M., Stanton C., Fitzgerald G. F., Ross R. P. Survival of probiotic lactobacilli in acidic environments is enhanced in the presence of metabolizable sugars. Appl Environ Microbiol. 2005; 71 (6): 3060-3067. DOI: 10.1128/AEM.71.6.3060-3067.2005.
19. Martins F. S., Silva A. A., Vieira A. T., Barbosa F. H., Arantes R. M., Teixeira M. M., Nicoli J. R. Comparative study of Bifidobacterium animalis, Escherichia coli, Lactobacillus casei and Saccharomyces boulardii probiotic properties. Arch. Microbiol. 2009; 191: 623-630.
20. Collado M. C., Meriluoto J., Salminen S. Role of commercial probiotic strains against human pathogen adhesion to intestinal mucus. Lett. Appl. Microbiol. 2007; 45: 454-460.
21. Ouwehand A. C., Bergsma N., Parhiala R., et al. Bifidobacterium microbiota and parameters of immune function in elderly subjects. FEMS Immunol Med Microbiol. 2008; 53: 18-25. DOI: 10.1111/j.1574-695X.2008.00392.x.
22. Корниенко Е. А., Нетребенко О. К. Пробиотики: механизмы действия и показания в соответствии с международными рекомендациями в педиатрии. Педиатрия. Журнал им. Г. Н. Сперанского. 2016; 95 (1): 109-121. / Kornienko E. A., Netrebenko O. K. Probiotics: mechanisms of action and indications in accordance with international recommendations in pediatrics. Pediatriya. Zhurnal im. G. N. Speranskogo. 2016; 95 (1): 109-121. (In Russ.)
23. Martinez-Martinez M. I., Calabuig-Tolsa R., Cauli O. The effect of probiotics as a treatment for constipation in elderly people: a systematic review. Arch Gerontol Geriatr. 2017; 71: 142-149. DOI: 10.1016/j.archger.2017.04.004.

Т. А. Руженцова¹
В. В. Дудурич²

¹ Московский медицинский университет «Реавиз», Москва, Россия, ruzhencova@gmail.com, https://orcid.org/0000-0002-6945-2019, Scopus Author ID 57193900159
² Московский медицинский университет «Реавиз», Москва, Россия, vasilisadudurich@yandex.ru

Сведения об авторах:

Руженцова Татьяна Александровна, д.м.н., заведующая кафедрой внутренних болезней, заведующая кафедрой клинической медицины, Частное учреждение образовательная организация высшего образования Московский медицинский университет «Реавиз»; 107564, Россия, Москва, ул. Краснобогатырская, 2, стр. 2; ruzhencova@gmail.com

Дудурич Василиса Валерьевна, ассистент кафедры клинической медицины, Частное учреждение образовательная организация высшего образова­ния Московский медицинский университет «Реавиз»; 107564, Россия, Москва, ул. Краснобогатырская, 2, стр. 2; vasilisadudurich@yandex.ru

Information about the authors:

Tatiana A. Ruzhentsova, Dr. of Sci. (Med.), Head of the Department of Internal Diseases, Head of the Department of Clinical Medicine, Private institution educational organization of higher education Moscow Medical University «Reaviz»; 2, b. 2 Krasnobogatyrskaya str., Moscow, 107564, Russia; ruzhencova@gmail.com

Vasilisa V. Dudurich, assistant of the Department of Clinical Medicine, Private institution educational organization of higher education Moscow Medical University «Reaviz»; 2, b. 2 Krasnobogatyrskaya str., Moscow, 107564, Russia; vasilisadudurich@yandex.ru

Значение метагеномного секвенирования и выбора пробиотической терапии у пациента с длительной диареей/ Т. А. Руженцова, В. В. Дудурич
Для цитирования: Руженцова Т. А., Дудурич В. В. Значение метагеномного секвенирования и выбора пробиотической терапии у пациента с длительной диареей. Лечащий Врач. 2026; 10 (29): 86-93. https://doi.org/10.51793/OS.2026.29.10.011
Теги: кишечник, воспаление, метагеномное секвенирование, микробиом, диарея